功能分子设计与界面过程实验室于2013年12月批准立项建设，所属学科领域为化学。实验室依托化学学科，可填补我省相关界面过程领域研究平台，提升我校化学学科研究特色，实现错位发展，提高科研水平，服务地方经济建设。实验室主要设置三个研究方向：分子组装与合成化学、应用催化与分子模拟、现代分离与分析技术。实验室实行研究队伍开放，积极为中青年教师创造进修和合作研究的机会，稳定中青年核心队伍，也可以接收外单位的职员来进修和合作，同时也是培养学院研究生的重要基地。平台自成立以来，实验室科研人员承担国家自然科学基金10项、省部级以上项目30多项，发表SCI论文100多篇，获国家发明专利授权12项，成果转让2项。获安徽省科学技术二等奖1项、三等奖1项。